对口支援是以习近平同志为核心的党中央对新疆各族人民的亲切关怀。2011年，教育部将中南大学、吉林大学、北京中医药大学列为我校全面对口支援高校；2021年，教育部新增列中国药科大学、温州医科大学为我校对口支援高校。五所对口支援高校积极发挥各自学科、资源优势，通过“包建”“院包科”“博士单列培养”“一对一指导”等方式，与我校联合培养学生、联合科研、集体备课等，双方建立了“学校与学校、学科与学科、学院与学院、附院与附院”全领域、深层次合作新格局。

同时，新疆医科大学及附属医院与北京大学医学部、复旦大学及上海医学院、中山大学及附属医院以及兰州大学、西安交通大学、武汉大学、山东大学等近30所高校及附属医院建立了友好协作关系，各友好协作高校及附院选派优秀援疆干部累计约400余名。

各对口支援高校及友好协作高校对我校人才培养、学科建设、科学研究、医疗和管理服务等各工作给予了大力支持和无私帮助，为服务新疆医学教育事业和维护边疆各族人民生命健康做出了积极贡献，为推进中国式现代化新疆实践发挥了积极作用。

新疆医科大学积极响应国家“一带一路”倡议，把握自治区“丝绸之路经济带核心区建设”的重要机遇，积极加入“一带一路”国际医学教育联盟（BRIMEA）和医药发展联盟，不断深化与“一带一路”沿线国家及其他国（境）外知名院校和科研院所实质性、深层次合作与交流，与塔吉克斯坦、哈萨克斯坦、格鲁吉亚、俄罗斯、日本、英国等多个国家的大学及研究机构建立了友好合作交流关系。

根据学科发展需求，派出优秀教师和管理人员出国（境）访学研修和学习提升，培养具有国际视野，学术精深、立德树人的高素质教师队伍；举办高规格、高质量国际会议；持续组织和开展好各类项目申报工作；开拓创新，努力实现我校中外合作办学，加强学科建设和人才培养，提高学校整体办学质量和水平。留学生们也为新医大的校园文化注入了新的活力，中外学生通过交流促进和加深了不同文化之间的理解，开阔了国际视野，同时也提升我校国际化教育水平和国际影响力。